HOME刊行したガイドラインについてはこちらをご覧ください。
RSV感染症診療の手引き
※閲覧にはIDとパスワードが必要です。 （2024.10.11）
呼吸器及び尿路感染症におけるブレイクポイント：新規抗菌薬の追加（2023）（2023.8.18）
腸管感染症診療の現状についてのアンケート調査（2021.3.31）
炎症性疾患に対する生物学的製剤と呼吸器疾患診療の手引き第2版 
（編集：日本呼吸器学会 炎症性疾患に対する生物学的製剤と呼吸器疾患 診療の手引き 第2版作成委員会、協力：一般社団法人日本リウマチ学会、一般社団法人日本結核・非結核性抗酸菌症学会、一般社団法人日本感染症学会）（2020.8.7）
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消化器内視鏡の洗浄・消毒標準化にむけたガイドライン（日本消化器内視鏡学会雑誌）（2020.6.5）
感染症遺伝子検査についての第2回アンケート調査結果（2020.5.27）
救急外来部門における感染対策チェックリスト（2020.3.31）
MRSA感染症の治療ガイドライン―改訂版―2019（2019.6.14）
全国の診療所医師を対象とした抗菌薬適正使用に関するアンケート調査（2019.5.30）
Clostridioides (Clostridium) difficileの感染症 診療ガイドライン（フローチャートとクリニカルクエスチョン部分のみ）（2018.12.3）
小児に対するキノロン薬の使用状況に関するアンケート調査成績（2018.10.4）
JAID/JSC 感染症治療ガイドライン2018―男性尿道炎とその関連疾患―（2018.5.25）
小児感染症分離株における感受性サーベイランス（2018.5.25）
感染症遺伝子検査についてのアンケート調査結果（2018.5.25）
JAID/JSC感染症治療ガイドライン2017―敗血症およびカテーテル関連血流感染症―（感染症学雑誌92巻1号 2018.1.20発行）（2018.2.1）
抗菌薬適正使用支援プログラム実践のためのガイダンス（2017.8.21）
肺炎球菌ワクチン再接種のガイダンス（改訂版）（2017.7.27）
JAID/JSC感染症治療ガイドライン2016―歯性感染症―（2016.7.29）
JAID/JSC Guidelines for the Treatment of Respiratory Infectious Diseases（2016.6.21）
JAID/JSC感染症治療ガイドライン2015―尿路感染症・男性性器感染症―（2016.2.4）
JAID/JSC感染症治療ガイドライン2015―腸管感染症―（2016.2.4）
JAID/JSC感染症治療ガイドライン―呼吸器感染症―（2014.1.20）
肺炎球菌ワクチン再接種に関するガイドライン（2009.10.19）
新型インフルエンザ 診療ガイドライン（第1版）（2009.9.15）
「抗MRSA薬使用の手引き」の掲載にあたって（2008.8.27）
